就在真田昌幸入主袛园城后，小山秀纲便立即识相的将自己的家督之位让出，并且主动将自己的正室——北条氏政的养女休了并且将其赶出下野。真田昌幸也随之暂时舍弃自己真田的苗字，从而改名为小山朝幸。小山领从此以后就正式并入了上杉家的版图。而小山秀纲并无怨言的带上自己的行李和家眷搬入了袛园城附近的支城——榎本城。小山秀纲也开始了和自己早就隐居的父亲小山高朝一起在榎本城隐居。
而明智光忠、秋山定纲、木户范秀、萱原为繁、广田直繁等下野的上杉家臣和代官们也获得了可以进入小山领检地的权利。因为朝定没有继续承认小山家拥有‘守护不入’的特权。
下野鹫小山家就这样在永禄元年七月底正式从战国大名转变为上杉家下辖的一个小势力。只不过，这也是一个过渡阶段。朝定并不会让鹫小山家继续存在，派遣真田昌幸继任小山家的家督也是为了快速消化它。鹫小山家可是占据着下野通往下总、常陆的通道。这类的兵家必争之地朝定可不会放任有外人打理。
随着小山家的臣服，下野诸将中一个接着一个遭到了战后清算。先是茂木一族被没收全领后赶出下野，然后壬生八田家、鹿沼八田家、盐谷八田家也是先后被没收其领由明智光忠率军进驻和接管。皆川小山家、益子家等也被赶出了下野而逃往常陆投奔小田家······
至于下野各郡夺取的新领地除去小山城和袛园城的两万三千石属于小山朝幸外，各重镇如茂木城、益子城、真冈城、多功城、皆川城、壬生城、宇都宫城等朝定准备派出自己的侧近或者代官去接管。
对于下野的迅速丢失，足利藤氏已经不敢在短时间内再次举兵，他只能在小田领内养精蓄锐。关东八国的公方奉公众们已经是所剩无几，曾经仰仗的小山家现如今也改弦易张。
常陆一国如今的局势也不算太稳定。北部有佐竹家占据，而东部沿海一带还有一个势力不小而降服于上杉家的江户家；南部地区也有鹿岛家、岛崎家等割据。可以说小田家的周围没有一个盟友存在，就算势力在常陆国内不算太小，可是其领地在北、西、南三面都接壤上杉领。小田氏治根本就不敢轻举妄动。
就在小田氏治胆战心惊的同时，朝定让曾我佑俊领有茂木城一万石知行、高井右近（户番）领有真冈城一万石知行。而明智光忠在下野的屡立战功，故转封宇都宫城领有一万三千石知行，依旧为明智光秀的名代镇守那须郡。
朝定一心想先稳住下野时，织田信长却和武田信玄谈和了。一方面织田信长承认武田家领有东美浓四郡，另一方面松平家也停止了对武田家的袭扰。这对于上杉家来说绝对是一个坏消息。
先不说加贺、能登方面的净土真宗的门徒众即将对越中发起侵攻，武田信玄现在已经能腾出手来了，他将马场信房放到深志城，准备编制飞弹侵袭军。而海津城方面武田信玄也不打算放弃，他将原虎胤部一千军势派出并且进驻海津城。这样一来斋藤朝信等人只能各自退回本领小心防御。只不过，武田信玄却没有办法去救援被困在西上野的内藤昌丰了。
谦信早就对武田信玄的所作所为忍无可忍，她将小虎千代托付给绫姬后拿着自己的小豆长光骑上自己的放生月毛就往上野国去了。她不准备先回越后而是去上野国的一之宫贯前神社参拜，并且写下了一封起请文：
“敬曰：夫我神社，菩萨真身乃无量寿佛，遥经十万亿年来日。父为仲哀天皇，母为神功皇后，在胎内时业已征伐三韩归朝。死后为百王百代镇护，以八幡宫显灵，故于九州丰前国建宇佐宫斋祀。是后，清和天皇御宇请奉城州男山，石清水流遍满六十余州，以致日本全国无地无八幡御社。彼信浓国更科郡亦有奏请，人人崇敬。今有佞臣武田晴信，乱入本国，施压暴威，悉灭本国藩士，破坏神社佛塔，国内悲叹经年。景虎虽对晴信了无必斗之宿恨，然为邻国越后国守，不能默视，又为襄助见弃之本国豪族所托。今以晴信为敌激发军功，于他毫无私利私欲之念。吾闻神受非礼不予，纵令晴信有信仰之心，然以非份之望夺国，无故骚扰本国领主，侵乱万民，神明有灵，何能感动？伏维乞愿。景虎明此精诚，垂予佑功。倘信州如景虎之意归于宁谧，景虎扬家名于天下，成就所愿。愿进神领一所，并以丹诚虔奉。为求信越两国荣华长享，万民喜悦，谨祈如存。永禄元年八月一日八幡宫御宝前长尾弹正少弼平景虎”
随后，谦信迅速返回越后春日山城后，大川忠秀、大川长秀父子立即进入春日山城请罪。并且他们二人又去将元井为宗、长尾景国等人说服后开城投降。到了最后，藏王城城主丸田高俊也在开城投降后主动说服上杉景信开城。到了八月十日，长尾景房完全成了孤家寡人。原本引为外援的武田信玄已经将大军撤回了甲斐，而自己旗下的国人众、原上杉家臣们又都纷纷开城投降。
仅仅数天，‘越后永禄之乱’瞬间平定。而参与长尾景房举兵的国人众、越后诸将们也都纷纷前往春日山城参见谦信。
“参见管领殿，罪臣长尾十郎景信前来请罪。”上杉景信不敢自称‘上杉’的苗字，只能自称‘长尾’的苗字，就怕使得谦信发怒。
“舅父何出此言？既然主动开城，就有改过之心。你仍然享有一门众笔头的身份和使用‘上杉’苗字的权利。”对于他人谦信是不会太过于大度，而对于自己的舅舅上杉景信，谦信相信他是迫不得已的。而自己身上还流有栖吉长尾家的血，所以说至于栖吉长尾家的处分也仅仅是将原先赐予的‘郡司不入’特权废除而已。
“谢主公。”上杉景信也不多说什么，随即坐到一边的蒲团上去。
“诸位都听着，此次的事件罪魁祸首只有一人——长尾景房。其余人等皆可宽恕。”谦信也不想处罚太多，毕竟此次的战乱已经让越后一国损失不少。而国人众们大都是因为长尾景房的身份和足利义辉、武田信玄的调略才跟随举兵的。只不过，长尾景房作为谦信的兄长故意破坏了越后一国的安宁，还致使越后诸将的互相残杀，这就让她感到非常的愤怒。
“非常感谢管领殿之大恩，我等此后一定竭力奉公！”由上杉景信起头，长尾景国、樋口兼丰、大川忠秀、大川长秀等人纷纷附和。
谦信是原谅了越后诸将，可是并没有原谅佐渡众。她令沿海各城的港口、凑都开始大建船只，准备一举平定佐渡，将一直劫掠海上商船的本间一族歼灭。
而还在长冈笼城的长尾景房也在天室光育的中介下开城，只不过长尾景房本人则是被押往武藏河越城。毕竟谦信对她自己的异母兄长还是下不了手，只能将其送至河越城交给朝定去处置。
而明智光忠、秋山定纲、木户范秀、萱原为繁、广田直繁等下野的上杉家臣和代官们也获得了可以进入小山领检地的权利。因为朝定没有继续承认小山家拥有‘守护不入’的特权。
下野鹫小山家就这样在永禄元年七月底正式从战国大名转变为上杉家下辖的一个小势力。只不过，这也是一个过渡阶段。朝定并不会让鹫小山家继续存在，派遣真田昌幸继任小山家的家督也是为了快速消化它。鹫小山家可是占据着下野通往下总、常陆的通道。这类的兵家必争之地朝定可不会放任有外人打理。
随着小山家的臣服，下野诸将中一个接着一个遭到了战后清算。先是茂木一族被没收全领后赶出下野，然后壬生八田家、鹿沼八田家、盐谷八田家也是先后被没收其领由明智光忠率军进驻和接管。皆川小山家、益子家等也被赶出了下野而逃往常陆投奔小田家······
至于下野各郡夺取的新领地除去小山城和袛园城的两万三千石属于小山朝幸外，各重镇如茂木城、益子城、真冈城、多功城、皆川城、壬生城、宇都宫城等朝定准备派出自己的侧近或者代官去接管。
对于下野的迅速丢失，足利藤氏已经不敢在短时间内再次举兵，他只能在小田领内养精蓄锐。关东八国的公方奉公众们已经是所剩无几，曾经仰仗的小山家现如今也改弦易张。
常陆一国如今的局势也不算太稳定。北部有佐竹家占据，而东部沿海一带还有一个势力不小而降服于上杉家的江户家；南部地区也有鹿岛家、岛崎家等割据。可以说小田家的周围没有一个盟友存在，就算势力在常陆国内不算太小，可是其领地在北、西、南三面都接壤上杉领。小田氏治根本就不敢轻举妄动。
就在小田氏治胆战心惊的同时，朝定让曾我佑俊领有茂木城一万石知行、高井右近（户番）领有真冈城一万石知行。而明智光忠在下野的屡立战功，故转封宇都宫城领有一万三千石知行，依旧为明智光秀的名代镇守那须郡。
朝定一心想先稳住下野时，织田信长却和武田信玄谈和了。一方面织田信长承认武田家领有东美浓四郡，另一方面松平家也停止了对武田家的袭扰。这对于上杉家来说绝对是一个坏消息。
先不说加贺、能登方面的净土真宗的门徒众即将对越中发起侵攻，武田信玄现在已经能腾出手来了，他将马场信房放到深志城，准备编制飞弹侵袭军。而海津城方面武田信玄也不打算放弃，他将原虎胤部一千军势派出并且进驻海津城。这样一来斋藤朝信等人只能各自退回本领小心防御。只不过，武田信玄却没有办法去救援被困在西上野的内藤昌丰了。
谦信早就对武田信玄的所作所为忍无可忍，她将小虎千代托付给绫姬后拿着自己的小豆长光骑上自己的放生月毛就往上野国去了。她不准备先回越后而是去上野国的一之宫贯前神社参拜，并且写下了一封起请文：
“敬曰：夫我神社，菩萨真身乃无量寿佛，遥经十万亿年来日。父为仲哀天皇，母为神功皇后，在胎内时业已征伐三韩归朝。死后为百王百代镇护，以八幡宫显灵，故于九州丰前国建宇佐宫斋祀。是后，清和天皇御宇请奉城州男山，石清水流遍满六十余州，以致日本全国无地无八幡御社。彼信浓国更科郡亦有奏请，人人崇敬。今有佞臣武田晴信，乱入本国，施压暴威，悉灭本国藩士，破坏神社佛塔，国内悲叹经年。景虎虽对晴信了无必斗之宿恨，然为邻国越后国守，不能默视，又为襄助见弃之本国豪族所托。今以晴信为敌激发军功，于他毫无私利私欲之念。吾闻神受非礼不予，纵令晴信有信仰之心，然以非份之望夺国，无故骚扰本国领主，侵乱万民，神明有灵，何能感动？伏维乞愿。景虎明此精诚，垂予佑功。倘信州如景虎之意归于宁谧，景虎扬家名于天下，成就所愿。愿进神领一所，并以丹诚虔奉。为求信越两国荣华长享，万民喜悦，谨祈如存。永禄元年八月一日八幡宫御宝前长尾弹正少弼平景虎”
随后，谦信迅速返回越后春日山城后，大川忠秀、大川长秀父子立即进入春日山城请罪。并且他们二人又去将元井为宗、长尾景国等人说服后开城投降。到了最后，藏王城城主丸田高俊也在开城投降后主动说服上杉景信开城。到了八月十日，长尾景房完全成了孤家寡人。原本引为外援的武田信玄已经将大军撤回了甲斐，而自己旗下的国人众、原上杉家臣们又都纷纷开城投降。
仅仅数天，‘越后永禄之乱’瞬间平定。而参与长尾景房举兵的国人众、越后诸将们也都纷纷前往春日山城参见谦信。
“参见管领殿，罪臣长尾十郎景信前来请罪。”上杉景信不敢自称‘上杉’的苗字，只能自称‘长尾’的苗字，就怕使得谦信发怒。
“舅父何出此言？既然主动开城，就有改过之心。你仍然享有一门众笔头的身份和使用‘上杉’苗字的权利。”对于他人谦信是不会太过于大度，而对于自己的舅舅上杉景信，谦信相信他是迫不得已的。而自己身上还流有栖吉长尾家的血，所以说至于栖吉长尾家的处分也仅仅是将原先赐予的‘郡司不入’特权废除而已。
“谢主公。”上杉景信也不多说什么，随即坐到一边的蒲团上去。
“诸位都听着，此次的事件罪魁祸首只有一人——长尾景房。其余人等皆可宽恕。”谦信也不想处罚太多，毕竟此次的战乱已经让越后一国损失不少。而国人众们大都是因为长尾景房的身份和足利义辉、武田信玄的调略才跟随举兵的。只不过，长尾景房作为谦信的兄长故意破坏了越后一国的安宁，还致使越后诸将的互相残杀，这就让她感到非常的愤怒。
“非常感谢管领殿之大恩，我等此后一定竭力奉公！”由上杉景信起头，长尾景国、樋口兼丰、大川忠秀、大川长秀等人纷纷附和。
谦信是原谅了越后诸将，可是并没有原谅佐渡众。她令沿海各城的港口、凑都开始大建船只，准备一举平定佐渡，将一直劫掠海上商船的本间一族歼灭。
而还在长冈笼城的长尾景房也在天室光育的中介下开城，只不过长尾景房本人则是被押往武藏河越城。毕竟谦信对她自己的异母兄长还是下不了手，只能将其送至河越城交给朝定去处置。